傅青主出生于1607年，山西太原人，本名叫傅山，字青竹，后来改为青主，在梁羽生小说《七剑下天山》的电视剧版本中，他是明朝锦衣卫出生，在明朝灭亡，清兵入关后，他跑到天山，寻找剑客一起抗清，历史上真实的傅青主根本不是锦衣卫，不过会武功是真的，经历也比小说写的更传奇。
傅青主出生于书香世家，他爷爷的爸爸傅朝宣跟他爷爷傅霖都当过明朝的大官，他老爸傅子谟不想当官，专心做学问，所以傅青主从小就受到了良好的教育，1627年，20岁的傅青主参加科举，考中秀才第一名，按照规定，可以享受明朝的财政补贴。
1629年，22岁的傅青主娶了一个门当户对的大家闺秀张静君，张静君是个才女，比他小两岁，两人郎才女貌，简直就是天作之合，第二年，他们的儿子傅眉出生了，一家人其乐融融。
但是自古红颜命薄，张静君身体不好，25岁就生病去世了，傅青主伤心欲绝，发誓终生不再娶其他女子，出于对老婆的愧疚和怀念，同时也为了避免更多的女子不再受妇科病的困扰，傅青主决定学习中医知识，尤其是妇科。
经过几年的学习，后来又经过几十年的不断实践中摸索创新，傅青主在中医内科，外科，男科，妇科，小儿科的水平都很高，堪称“五科圣手”，其中尤其以妇科最为擅长，他写的《傅青主女科》一书，直到现在都还是学中医妇科的人必读之书，可见影响力之深。
1638年，明末名臣袁继贤修复了当年魏忠贤破坏了的三立书院，选取了天赋比较好的300名学子进入书院学习，其中就包括傅青主，并且袁继贤非常欣赏傅青主，认为他将来成就一定会很高。
三立书院的前身是1530年，山西按察副使陈讲，在现在的太原市公安局所在地建立的晋阳书院，那里那个时候还是一块菜地，后来到了万历初年，为了纪念黄河，汾河地区的三位文学大师王通，司马光，薛瑄，山西按察副使利用老巡抚衙门的房子，对书院进行了扩建，并且改名为三立书院。
后来到了清朝，又几次扩建，在雍正年间改回晋阳书院的名字，1902年，山西巡抚岑春煊，将晋阳书院跟1883年张之洞建立的令德书院，合并为了山西国立大学堂，后来又几经改名，就是现在的太原理工大学。
后来袁继贤被奸臣陷害，关到了牢里，傅青主跟玩得好的薛宗周带着山西的学子们跑到北京城，拦下了首辅大臣刘宇亮的轿子，向首辅大臣陈述事实，想要救出自己老师，后来崇祯皇帝听说后，下令彻查袁继贤案，第二年袁继贤沉冤得雪，官复原职。
明朝灭亡后，清朝发出“剃发令”，强制要求汉人剃发，不过宗教人士除外，傅青主不想剃个猪尾巴，于是跑到山西寿阳县五峰山，拜山里的道士郭静中为师傅，当了道士，学习道术以及内家拳法。
道士一般都是穿黑色道袍，傅青主认为明朝皇帝姓朱，朱就是红色，所以穿着红色道袍，以示自己不忘明朝的决心，当时人称“朱衣道人”，1984年山西灵石县曾经发现了一本《傅山拳法》，经过鉴定，确实就是傅青主流传的拳谱，这可是真实历史上的武功秘籍啊。
傅青主当了道士后，多次利用自己宗教人士以及医生的身份，为抗清义军传送情报，1647年，南明永历皇帝派遣总兵宋谦前往北方地区，联络民间傅青主等反清人士，选择时机在北方发动起义。
1654年宋谦准备攻打涉县，结果在路过武安县的时候，被清兵发现了他们带的武器，于是宋谦等9名起义军首领被清兵活抓，后来因为经不住清兵的大刑，于是把傅青主招了出来，随后宋谦等首领被清兵杀害。
1655年，清兵把傅青主跟他儿子傅眉，他弟弟傅止一起抓了起来，不过他们早就做好了串供的准备了，几人坚持不认罪，宋谦已经死了，死无对证，再加上傅青主曾经为清朝山西布政使魏一鳌跟山西按察使杨思圣治过病，他们为傅青主作证，他们去找傅青主治病的时候，亲眼看到傅青主拒绝了宋谦的邀请，于是清兵又把傅青主几人放了。
后来傅青主南下，亲眼看到南方的抗清义军因为内讧严重，被清兵各个击破，感觉明朝应该是大势已去，复国无望，于是回到太原，归隐田园了。
1678年，康熙为了收买明朝遗民的人心，下旨让三品以上官员推荐民间有才能的人，面见康熙，康熙亲自录用，有大臣推荐了傅青主，但傅青主托病不肯去，被阳曲知县戴梦雄强行绑到北京，到了北京后，傅青主死活不肯进城，戴梦雄也不敢再用强，于是住在城外的圆教寺里，每天躺在床上装病，不肯去参加康熙的面试。
康熙听说后也没生气，派了些官员去看他，还册封了傅青主一个官职，傅青主看到官员到来也不管，就躺在床上发呆，清朝官员说了半天他都没一点反应，宣读圣旨封他做内阁中书大臣，他也没有磕头谢恩，康熙听说后，表示能够理解。
1684年2月7号，傅青主的儿子傅眉去世了，白发人送黑发人，傅青主很伤心，一病不起，6月12日，傅青主也去世了，享年77岁，下葬的时候，仍然是身穿红衣道袍，当地上千人自发为他送行。
傅青主一生多才多艺，能文能武能治病，书画水平也很高，道术也很高明，当代武侠小说大师梁羽生很崇拜傅青主，于是将他写进了《七剑下天山》，成为一代大侠。
